Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms