Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM139Q8IV31 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM139Q8IV31 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM139Q8IV31 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms