Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms