Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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