Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT28Q7Z3Y7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms