Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SETXQ7Z333 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SETXQ7Z333 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SETXQ7Z333 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SETXQ7Z333 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SETXQ7Z333 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SETXQ7Z333 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SETXQ7Z333 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SETXQ7Z333 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SETXQ7Z333 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SETXQ7Z333 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SETXQ7Z333 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SETXQ7Z333 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SETXQ7Z333 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms