Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM47EQ6ZV65 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM47EQ6ZV65 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms