Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

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Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
UBR3Q6ZT12 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
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