Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXC1

MAMDC4, Apical endosomal glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAMDC4Q6UXC1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MAMDC4Q6UXC1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MAMDC4Q6UXC1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAMDC4Q6UXC1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms