Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A10Q6U841 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A10Q6U841 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms