Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFWD3Q6PCD5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms