Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6P435 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6P435 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6P435 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6P435 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6P435 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6P435 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6P435 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6P435 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6P435 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6P435 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6P435 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6P435 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6P435 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q6P435 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q6P435 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q6P435 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q6P435 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6P435 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6P435 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6P435 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6P435 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6P435 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6P435 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6P435 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6P435 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6P435 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6P435 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6P435 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6P435 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6P435 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6P435 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6P435 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6P435 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6P435 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6P435 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6P435 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6P435 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6P435 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6P435 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6P435 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6P435 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6P435 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6P435 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6P435 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6P435 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6P435 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6P435 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6P435 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6P435 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6P435 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6P435 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6P435 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6P435 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6P435 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6P435 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6P435 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6P435 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6P435 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6P435 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6P435 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6P435 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6P435 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6P435 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6P435 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6P435 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6P435 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6P435 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6P435 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6P435 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6P435 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6P435 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6P435 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6P435 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6P435 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6P435 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6P435 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6P435 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6P435 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6P435 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6P435 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6P435 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6P435 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6P435 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6P435 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6P435 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6P435 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6P435 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6P435 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6P435 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6P435 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6P435 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6P435 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6P435 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6P435 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6P435 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6P435 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6P435 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6P435 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6P435 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms