Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms