Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms