Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCSD1Q6JBY9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms