Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
DUPD1Q68J44 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms