Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USPL1Q5W0Q7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms