Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms