Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF220Q5VTB9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms