Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LGSNQ5TDP6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LGSNQ5TDP6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LGSNQ5TDP6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LGSNQ5TDP6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LGSNQ5TDP6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LGSNQ5TDP6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LGSNQ5TDP6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LGSNQ5TDP6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LGSNQ5TDP6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LGSNQ5TDP6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms