Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms