Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FRMPD1Q5SYB0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FRMPD1Q5SYB0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
FRMPD1Q5SYB0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FRMPD1Q5SYB0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
FRMPD1Q5SYB0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FRMPD1Q5SYB0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FRMPD1Q5SYB0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FRMPD1Q5SYB0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FRMPD1Q5SYB0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FRMPD1Q5SYB0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FRMPD1Q5SYB0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
FRMPD1Q5SYB0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms