Protein–RNA interactions for Protein: Q5SGD2

PPM1L, Protein phosphatase 1L, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1LQ5SGD2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1LQ5SGD2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPM1LQ5SGD2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPM1LQ5SGD2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPM1LQ5SGD2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPM1LQ5SGD2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPM1LQ5SGD2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPM1LQ5SGD2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPM1LQ5SGD2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPM1LQ5SGD2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPM1LQ5SGD2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPM1LQ5SGD2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPM1LQ5SGD2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms