Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTN6

WDR38, WD repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR38Q5JTN6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR38Q5JTN6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR38Q5JTN6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms