Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms