Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACSM3Q53FZ2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms