Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CEP55Q53EZ4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP55Q53EZ4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms