Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms