Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms