Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf22Q49AR2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf22Q49AR2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms