Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZBED5Q49AG3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZBED5Q49AG3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms