Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP27-1Q3LI81 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP27-1Q3LI81 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms