Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms