Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UVSSAQ2YD98 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms