Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VWC2Q2TAL6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms