Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms