Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTC1Q2NKJ3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTC1Q2NKJ3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms