Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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