Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIL3Q16649 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms