Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTF1Q16619 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms