Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM1Q16610 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
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