Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK3Q16288 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTRK3Q16288 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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