Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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SNCBQ16143 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
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SNCBQ16143 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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SNCBQ16143 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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SNCBQ16143 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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SNCBQ16143 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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SNCBQ16143 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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SNCBQ16143 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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SNCBQ16143 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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SNCBQ16143 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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SNCBQ16143 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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