Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ZNF56Q15929 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ZNF56Q15929 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ZNF56Q15929 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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ZNF56Q15929 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF56Q15929 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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