Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms