Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX1Q15475 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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