Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KARSQ15046 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KARSQ15046 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KARSQ15046 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KARSQ15046 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KARSQ15046 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KARSQ15046 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KARSQ15046 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KARSQ15046 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KARSQ15046 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KARSQ15046 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KARSQ15046 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KARSQ15046 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KARSQ15046 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KARSQ15046 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KARSQ15046 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KARSQ15046 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KARSQ15046 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KARSQ15046 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KARSQ15046 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KARSQ15046 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KARSQ15046 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KARSQ15046 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KARSQ15046 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KARSQ15046 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KARSQ15046 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KARSQ15046 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KARSQ15046 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KARSQ15046 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KARSQ15046 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KARSQ15046 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KARSQ15046 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KARSQ15046 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KARSQ15046 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KARSQ15046 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KARSQ15046 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KARSQ15046 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KARSQ15046 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KARSQ15046 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KARSQ15046 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KARSQ15046 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KARSQ15046 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KARSQ15046 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KARSQ15046 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KARSQ15046 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KARSQ15046 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KARSQ15046 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KARSQ15046 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KARSQ15046 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KARSQ15046 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KARSQ15046 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KARSQ15046 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KARSQ15046 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KARSQ15046 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KARSQ15046 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KARSQ15046 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KARSQ15046 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KARSQ15046 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KARSQ15046 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KARSQ15046 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KARSQ15046 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KARSQ15046 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KARSQ15046 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KARSQ15046 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KARSQ15046 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KARSQ15046 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KARSQ15046 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KARSQ15046 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KARSQ15046 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KARSQ15046 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KARSQ15046 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KARSQ15046 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KARSQ15046 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KARSQ15046 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KARSQ15046 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KARSQ15046 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KARSQ15046 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KARSQ15046 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KARSQ15046 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KARSQ15046 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KARSQ15046 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KARSQ15046 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KARSQ15046 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KARSQ15046 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KARSQ15046 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KARSQ15046 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KARSQ15046 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KARSQ15046 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KARSQ15046 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KARSQ15046 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KARSQ15046 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KARSQ15046 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KARSQ15046 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KARSQ15046 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KARSQ15046 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KARSQ15046 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KARSQ15046 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KARSQ15046 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KARSQ15046 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KARSQ15046 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
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