Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD6Q15008 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD6Q15008 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
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