Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
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