Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IHHQ14623 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IHHQ14623 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IHHQ14623 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IHHQ14623 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IHHQ14623 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IHHQ14623 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IHHQ14623 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IHHQ14623 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IHHQ14623 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IHHQ14623 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IHHQ14623 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IHHQ14623 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IHHQ14623 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IHHQ14623 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IHHQ14623 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IHHQ14623 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IHHQ14623 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IHHQ14623 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IHHQ14623 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IHHQ14623 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IHHQ14623 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IHHQ14623 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IHHQ14623 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IHHQ14623 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IHHQ14623 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IHHQ14623 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IHHQ14623 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IHHQ14623 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IHHQ14623 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IHHQ14623 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IHHQ14623 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IHHQ14623 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IHHQ14623 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IHHQ14623 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IHHQ14623 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IHHQ14623 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IHHQ14623 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IHHQ14623 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IHHQ14623 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IHHQ14623 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IHHQ14623 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IHHQ14623 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IHHQ14623 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IHHQ14623 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IHHQ14623 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IHHQ14623 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IHHQ14623 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IHHQ14623 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IHHQ14623 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IHHQ14623 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IHHQ14623 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IHHQ14623 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IHHQ14623 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IHHQ14623 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IHHQ14623 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IHHQ14623 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IHHQ14623 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IHHQ14623 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IHHQ14623 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IHHQ14623 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IHHQ14623 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IHHQ14623 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IHHQ14623 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IHHQ14623 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IHHQ14623 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IHHQ14623 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IHHQ14623 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IHHQ14623 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IHHQ14623 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IHHQ14623 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IHHQ14623 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IHHQ14623 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IHHQ14623 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IHHQ14623 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IHHQ14623 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IHHQ14623 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IHHQ14623 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IHHQ14623 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IHHQ14623 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IHHQ14623 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IHHQ14623 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IHHQ14623 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IHHQ14623 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IHHQ14623 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IHHQ14623 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IHHQ14623 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IHHQ14623 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IHHQ14623 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IHHQ14623 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IHHQ14623 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IHHQ14623 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IHHQ14623 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IHHQ14623 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IHHQ14623 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IHHQ14623 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IHHQ14623 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IHHQ14623 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IHHQ14623 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IHHQ14623 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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